บรรพชาเป็นสามเณร ฝ่ายมหานิกาย เมื่อปี พ.ศ. ๒๔๔๖ ขณะอายุย่างเข้า ๑๕ ปี ในสำนักพระอุปัชฌาย์ป้อง ณ วัดบ้านหนองขอน ตำบลหัวทะเล อำเภออำนาจเจริญ จังหวัดอุบลราชธานี

     บรรพชาอีกครั้งเป็นสามเณร ฝ่ายธรรมยุต ในสำนักพระครูสมุห์โฉม เจ้าอาวาสวัดสุทัศนาราม ตำบลในเมือง อำเภอเมือง จังหวัดอุบลราชธานี เมื่อวันพฤหัสบดีที่ ๕ กรกฎาคม พ.ศ. ๒๔๔๙

     อุปสมบท เมื่อวันที่ ๓๐ พฤศจิกายน พ.ศ. ๒๔๕๒ ณ พัทธสีมาวัดสุทัศนาราม จังหวัดอุบลราชธานี โดยมี สมเด็จพระมหาวีรวงศ์ (อ้วน ติสฺโส) เมื่อครั้งดำรงสมณศักดิ์ที่ พระศาสนดิลก เจ้าคณะมณฑลอิสาน เป็นพระอุปัชฌาย์ มี พระศาสนดิลก เมื่อครั้งยังเป็น พระมหาเสน ชิตเสโน เป็นพระกรรมวาจาจารย์ เเละพระปลัดทัศน์ เป็นพระอนุสาวนาจารย์ ได้นามฉายาว่า “ขนฺตยาคโม”

     หลวงปู่สิงห์ เป็นพระวิปัสสนากรรมฐาน ศิษย์สายหลวงปู่เสาร์ กนฺตสีโส หลวงปู่มั่น ภูริทตฺโต ท่านได้อยู่ศึกษาวัตรปฏิบัติกับครูบาอาจารย์ เเละได้ออกธุดงค์ไปในสถานที่ต่างๆ เพื่อแสวงหาความรู้ ปลีกวิเวก ทั้งติดตามครูบาอาจารย์