เมื่อปี พ.ศ. ๒๓๐๔ ได้เป็นที่ "พระเทพโมลี" อยู่ที่วัดหงส์ ในรัชสมัยพระบาทสมเด็จพระพุทธยอดฟ้าจุฬาโลก และได้เป็นที่ "พระพรหมมุนี" ในรัชสมัยพระบาทสมเด็จพระพุทธเลิศหล้านภาลัย ต่อมาได้เลื่อนขึ้นเป็นที่ "พระพิมลธรรม" เมื่อปี พ.ศ. ๒๓๕๙ ต่อมาได้เลื่อนเป็น "สมเด็จพระพนรัตน์" ในรัชกาลเดียวกัน ทรงเป็นสมเด็จพระสังฆราชองค์สุดท้ายที่สถิต ณ วัดมหาธาตุ เป็นพระราชอุปัธยาจารย์ของพระบาทสมเด็จพระจอมเกล้าเจ้าอยู่หัวซึ่งผนวชเมื่อปี พ.ศ. ๒๓๖๗

     พระบาทสมเด็จพระพุทธเลิศหล้านภาลัยทรงพระกรุณาโปรดสถาปนา สมเด็จพระพนรัตน (ด่อน) เป็น สมเด็จพระอริยวงษญาณ สมเด็จพระสังฆราช เมื่อเดือน ๔ ปีมะเมีย จ.ศ. ๑๑๘๔ ตรงกับ พ.ศ. ๒๓๖๕ แล้วโปรดให้แห่จากวัดหงส์รัตนาราม มาสถิต ณ วัดมหาธาตุยุวราชรังสฤษฎิ์ นับเป็นสมเด็จพระสังฆราช พระองค์ที่ ๕ แห่งกรุงรัตนโกสินทร์ ในตอนปลายสมัยของสมเด็จพระสังฆราช (ด่อน) ได้มีการชำระความสงฆ์ที่ประพฤติอนาจารมิควร นับเป็นการชำระสะสางอลัชชีในคณะสงฆ์ครั้งใหญ่ในประวัติการณ์ของคณะสงฆ์